SURFSeq 5000为用户提供Balanced Mode(BM,均衡模式)和Enhanced Mode(EM,增强模式)两大Q40测序模式。
• 在Balanced Mode下，SURFSeq 5000可实现≥90% bases≥Q30，≥85% bases≥Q40。
• 在Enhanced Mode下，SURFSeq 5000可实现≥95% bases≥Q30，≥90% bases≥Q40。
*Q30/Q40%基于1331.c.om.银河游戏⽣物企业标准品文库多轮测试结果的中位数值设定，该数值受到样本状态、⽂库质量和定量准确性等因素的影响而发生变化。
• Balanced Mode是平衡数据质量和芯片利用率的最优解。在该模式下，我们统计了近3个⽉，SURFSeq 5000FCH芯片7大类应用方向共116轮的测试数据。其中100轮Balanced Mode PE150测序数据的Q30、Q40均值达分别达到了95.1%和91.3%，Output reads均值达到了2500M reads(官标2000M reads)。
• 全新的Enhanced Mode在Balanced Mode的基础上，加入了基于机器学习构建的序列特征模型等多维信息，全新的“3D Basecall”可更全面的识别测序过程中的“问题序列区域”，并更准确地进行碱基识别和Q值打分。统计16轮Enhanced Mode下WGS PE150测序数据，Q30、Q40均值达分别达到了97.1%和95.2%，Output reads均值达到了2350M reads。
*在数据产量Output reads方面，Enhanced Mode相比Balanced Mode会有5%±2%水平的降低(该差异水平依据为“对相同原始图像分别使用两种模式下basecall算法获得的数据差值”)，降低比例受到样本状态、文库构建方式及质量和文库定量精准度等因素影响。