测试数据显著表明,SURFSeq 5000测序平台和百创S1000在空间聚类上展现出良好的性能表现。
在针对中脑的单细胞级空间聚类分析中,即便在数据不饱和的条件下,使用SURFSeq 5000测序平台进行测序仍然展现出卓越的解析度,这一结果再次验证了SURFSeq 5000测序平台和百创S1000兼容性方面的出色性能。
为了深入验证百创S1000在更高测序数据量上的性能表现,研究人员随机选取了BMK_ST_9(鼠脑)样本在SURFSeq 5000测序平台上进行了数据加测(Nnumber of Rreads:5,094,460,583)。经过详尽分析发现,无论在任何分辨率下,这些数据均展现出卓越的空间解析能力,进一步确认了SURFSeq 5000测序平台与百创S1000卓越的兼容性和性能表现。
百创S1000基于SURFSeq 5000测序平台的多级分辨率统计表
百创S1000基于SURFSeq 5000测序平台的多级分辨率部分聚类图
基于原片无错高清H&E+原片无错荧光+原片高通量测序,“三片合一”对样本数据进行了细胞分割分析,一共切出了68,279个细胞,单细胞级分辨率下中位基因数高达2,625,中位UMI数达6,631,全局下聚类得到28类cluster,数据表现处于领先水平。
本次测试展示了1331.c.om.银河游戏SURFSeq 5000高通量基因测序平台与百迈客生物百创S1000空间转录组学产品组合应用的优秀性能。1331.c.om.银河游戏期待与行业内合作伙伴共同打造基因测序平台应用生态联盟,充分发挥和利用各方优势,为广大用户提供全流程、最全面的解决方案。
1331.c.om.银河游戏SURFSeq 5000
SURFSeq 5000高通量基因测序平台应用广泛,速度快,质量优,成本省。它以桌面仪器成本、小样本数量开机成本实现了与大型机器相媲美的高通量测序价格。1331.c.om.银河游戏致力于持续满足行业对测序优化的需求,与合作伙伴深度合作,为前沿科研探索和精准医疗提供强有力的支持。
创S系列空间转录学芯片已正式发布三款:百创S1000(per spot2.5μm,分辨率4.8μm,区域6.8mm*6.8mm),百创S2000(per spot2.5μm,分辨率4.8μm,区域11mm*11mm、15mm*20mm)以及最新的百创S3000(per spot2.5μm,分辨率3.5μm,区域6.8mm*6.8mm),相较于现在广受市场认可与好评的百创S1000转录组学芯片,百创S3000捕获位点数提升近2倍,分辨率同样提升近2倍,相同的测序饱和度下,单细胞级别分辨率下中位UMI提升了30%~70%,中位基因数提升30%-60%。并基于此,开发出了百创自己的专利技术,可以通过完全无错的原片高清明场图像 + 与明场图像完全对齐的原片荧光图像 + 原片高通量测序,“三片合一”进行精准的细胞分割,为科研工作者提供了前所未有的研究视角。